Podstatu a účel tohoto programu prozrazuje již jeho samotný název. MD5 Check je programem vytvořeným k tomu, aby prováděl výpočty MD5 souborů a následné výsledky porovnal s jiným MD5 a zjistil případnou shodu.
Rozhraní programu je jednoduché. V sekci "Filename" stačí jednoduše stačí zvolit soubor, u něhož chceme zjistit kontrolní součet a provést výpočet. Program tento součet vypočítá a zobrazí. A pokud chceme provést porovnání výsledného řetězce s jiným MD5 součtem (například abychom ověřili integritu právě staženého souboru) stačí tento druhý řetězec vložit a MD5 Check automaticky provede porovnání a nahlásí případný rozdíl.