AptDiff umí vizuálně porovnávat textové a binární soubory. Pro porovnání stačí vybrat dva soubory a okamžitě uvidíte barevně zvýrazněné rozdíly v obou souborech otevřených vedle sebe. Volitelně je k dispozici i spojování řádků z levé části do pravé či naopak.
Výsledek porovnání může být ve stejné podobě jak je zobrazen exportován do HTML souboru a dále publikován na webu, to vše se zachováním barevného zvýraznění. Mezi další funkce lze zařadit zálohování souborů, nastavení vlastních barev, podpora Unicode a další.