WISeCrypt vám poskytne vysoké zabezpečení při ochraně citlivých souborů. Program umí zabezpečit soubory zašifrováním. Pro práci s daty je samozřejmě možnost jejich dešifrování při znalosti správného hesla. Pakliže data už nepotřebujete a přesto jsou velmi důležitá, je k dispozici jejich bezpečné odstranění. Běžné odstranění souboru totiž data z pevného disku neodstraní, k jejich bezpečnému odstranění dojde až několikanásobným náhodným přepisem.
Mezi podporované algoritmy pro šifrování dat patří AES (Rijndael), 3DES, RSA, RC4 a další symetrické i nesymetrické algoritmy. Podporovány jsou i X.509 digitální certifikáty.